Περιεχόμενο
Τα πεπτίδια είναι θραύσματα μικρών πολυμερών που αποτελούνται από αμινοξέα. Κάθε πεπτίδιο έχει μια συγκεκριμένη αλληλουχία αμινοξέων που συμβολίζεται με έναν κωδικό τριών γραμμάτων ή μόνο έναν. Για παράδειγμα, το αμινοξύ αλανίνη συντομογραφείται ως "Ala" ή "Α". Το φορτίο των πεπτιδίων στο διάλυμα εξαρτάται από την οξύτητά του. Το ισοηλεκτρικό σημείο (ρΙ) αναφέρεται στην τιμή οξύτητας του διαλύματος στο οποίο το πεπτίδιο μόριο έχει καθαρό φορτίο ίσο με μηδέν. Η διαλυτότητα του πεπτιδίου είναι ελάχιστη στο ισοηλεκτρικό σημείο. Χρησιμοποιήστε τους διαθέσιμους διακομιστές ιστού για να υπολογίσετε την τιμή pI για μια αλληλουχία αμινοξέων ενός πεπτιδίου.
Βήμα 1
Ακολουθήστε την αλληλουχία του πεπτιδίου χρησιμοποιώντας τον κωδικό ενός γράμματος. Για παράδειγμα, εάν ένα πεπτίδιο έχει αλληλουχία αμινοξέων Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Αλανίνη - Σερίνη - Γλουταμικό οξύ - Λευκίνη - Προλίνη), τότε η αλληλουχία ενός γράμματος θα είναι "ASELP". Εάν είναι απαραίτητο, ανατρέξτε στον πίνακα μετατροπής από ένα γράμμα σε τρία γράμματα που παρέχεται στην ενότητα Πόροι.
Βήμα 2
Χρησιμοποιήστε οποιοδήποτε πρόγραμμα περιήγησης, όπως τον Internet Explorer ή τον Firefox, για να εισαγάγετε έναν διακομιστή που υπολογίζει το ισοηλεκτρικό σημείο ενός πεπτιδίου (pI). βλ. Πόρους.
Βήμα 3
Πληκτρολογήστε την ακολουθία ενός γράμματος του πεπτιδίου - στο παράδειγμά μας, "ASELP" - στο πλαίσιο και κάντε κλικ στο "Compute".
Βήμα 4
Διαβάστε την τιμή του ισοηλεκτρικού σημείου (pI) που δίνεται στη γραμμή "Θεωρητικό pI / Mw" (θεωρητικό pl). Στο παράδειγμά μας, το pI είναι 4,00. Σημειώστε ότι ο διακομιστής υπολογίζει επίσης το μοριακό βάρος (Mw) του πεπτιδίου.